تولَّى محمد حلمي تدريب نادي الزمالك، فترتين، حقق خلالهما الفوز ببطولة كأس السوبر المصري، على حساب النادي الأهلي.
وكانت الولاية الأولى في الفترة من 2 مايو 2016 حتى يوم 28 يوليه 2016.
وجاءت الولاية الثانية خلال الفترة من 30 نوفمبر 2016 حتى الآن.
ويرصد "ستاد مصر العربية"، مشوار المدير الفنى مع القلعة البيضاء خلال الولايتين.